tag:blogger.com,1999:blog-6399211197313259044.post5693562033832812811..comments2023-10-31T14:12:09.431+01:00Comments on Evolutiebiologie: Sorteren op weinig en sorteren op meer gegevensGerdien de Jonghttp://www.blogger.com/profile/00894162221492009289noreply@blogger.comBlogger5125tag:blogger.com,1999:blog-6399211197313259044.post-43493931481840136632009-07-16T20:47:18.641+02:002009-07-16T20:47:18.641+02:00Randi et al doen niet hetzelfde als ik hier doe in...Randi et al doen niet hetzelfde als ik hier doe in het blog. Wat er nog het meest op lijkt is hun figuur 3.<br />Randi et al geven de DNA volgorden van haplotypen - dwz ze geven de website op waar de haplotypen die ze gevonden hebben staan - , en ik maak er met ClustalW op verschillende manieren clusters van. Tot nu toe heb ik alleen <i>Felis silvestris silvestris</i> haplotypen gebruikt, dus het gaat om variatie binnen een soort, zelfs binnen een ondersoort. Het gaat me hier erom wat er gebeurt als je meer gegevens teovoegt, bij gebruik van een bot algemeen clusterings programma.Gerdien de Jonghttps://www.blogger.com/profile/00894162221492009289noreply@blogger.comtag:blogger.com,1999:blog-6399211197313259044.post-34221390160926600152009-07-16T11:19:35.351+02:002009-07-16T11:19:35.351+02:00Ik heb altijd gedacht dat fylogenetische bomen geb...Ik heb altijd gedacht dat fylogenetische bomen gebouwd worden met methoden om fylogenetische relaties (bijv tussen soorten) te onrafelen, en dat die methoden niet per definitie geschikt zijn om tokogenetische relaties (tussen individuen) te ontdekken en af te beelden.<br />Het lijkt met dat in dit stuk gen-bomen en soort-bomen door elkaar worden gehaald. <br />Ik ga nu eerst Randi et al maar eens lezen om te kijken wat ze precies hebben gedaan...Rino Zandeehttp://www.mzandee.nl/net/~zandee/news/noreply@blogger.comtag:blogger.com,1999:blog-6399211197313259044.post-22044138466838344232009-07-15T17:51:37.584+02:002009-07-15T17:51:37.584+02:00@DEEN
Dit zijn alle katten en alle basepaar uit de...@DEEN<br />Dit zijn alle katten en alle basepaar uit deze studie. Dat betekent dat niet met zekerheid te zeggen valt wat er gebeurt als er nog mee Italiaanse Wilde Katten toegevoegd worden - het kan zijn dat er 3 groepen blijken te zijn, maar het kan zijn dat er verdere differentiatie optreedt, en dat de lange lijnstukken opgebroken worden. <br />Aan het kaartje in de publicatie van Randi et al te zien komen de groepen niet overeen met verschillende gebieden.Gerdien de Jonghttps://www.blogger.com/profile/00894162221492009289noreply@blogger.comtag:blogger.com,1999:blog-6399211197313259044.post-82397305068260230742009-07-15T16:41:57.465+02:002009-07-15T16:41:57.465+02:00Dit blog heeft enige vertraging opgelopen door de ...Dit blog heeft enige vertraging opgelopen door de activiteiten die te vinden zijn op<br />http://landelijke-beta-actie.blogspot.com/Gerdien de Jonghttps://www.blogger.com/profile/00894162221492009289noreply@blogger.comtag:blogger.com,1999:blog-6399211197313259044.post-55746961042006989172009-07-15T16:07:32.537+02:002009-07-15T16:07:32.537+02:00De volgende vraag lijkt me dan: hoe verandert deze...De volgende vraag lijkt me dan: hoe verandert deze sortering als je meer katten toevoegt? Krijg je dan meer groepen? Of blijkt er juist een geleidelijke overgang te bestaan tussen twee groepen?DEENhttps://www.blogger.com/profile/01038312556912179499noreply@blogger.com